Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DCLRE1CQ96SD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCLRE1CQ96SD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCLRE1CQ96SD1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCLRE1CQ96SD1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCLRE1CQ96SD1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DCLRE1CQ96SD1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms