Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CSRNP1Q96S65 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CSRNP1Q96S65 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CSRNP1Q96S65 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CSRNP1Q96S65 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSRNP1Q96S65 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP1Q96S65 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSRNP1Q96S65 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP1Q96S65 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP1Q96S65 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSRNP1Q96S65 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP1Q96S65 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP1Q96S65 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP1Q96S65 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
CSRNP1Q96S65 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP1Q96S65 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP1Q96S65 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSRNP1Q96S65 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CSRNP1Q96S65 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
CSRNP1Q96S65 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CSRNP1Q96S65 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CSRNP1Q96S65 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CSRNP1Q96S65 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CSRNP1Q96S65 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CSRNP1Q96S65 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CSRNP1Q96S65 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CSRNP1Q96S65 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CSRNP1Q96S65 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CSRNP1Q96S65 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CSRNP1Q96S65 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CSRNP1Q96S65 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CSRNP1Q96S65 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CSRNP1Q96S65 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms