Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUBGCP5Q96RT8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP5Q96RT8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBGCP5Q96RT8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBGCP5Q96RT8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBGCP5Q96RT8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBGCP5Q96RT8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBGCP5Q96RT8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP5Q96RT8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP5Q96RT8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP5Q96RT8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP5Q96RT8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBGCP5Q96RT8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBGCP5Q96RT8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBGCP5Q96RT8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms