Protein–RNA interactions for Protein: Q96PS6

GAFA1, Putative uncharacterized protein GAFA-1, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAFA1Q96PS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAFA1Q96PS6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAFA1Q96PS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAFA1Q96PS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAFA1Q96PS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAFA1Q96PS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAFA1Q96PS6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAFA1Q96PS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GAFA1Q96PS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAFA1Q96PS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAFA1Q96PS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAFA1Q96PS6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAFA1Q96PS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAFA1Q96PS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GAFA1Q96PS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAFA1Q96PS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAFA1Q96PS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms