Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC43Q96MW1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC43Q96MW1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC43Q96MW1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC43Q96MW1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC43Q96MW1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC43Q96MW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC43Q96MW1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC43Q96MW1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC43Q96MW1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC43Q96MW1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC43Q96MW1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC43Q96MW1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC43Q96MW1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC43Q96MW1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC43Q96MW1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC43Q96MW1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC43Q96MW1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC43Q96MW1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC43Q96MW1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC43Q96MW1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC43Q96MW1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC43Q96MW1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC43Q96MW1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC43Q96MW1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC43Q96MW1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC43Q96MW1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC43Q96MW1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC43Q96MW1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms