Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
JPH4Q96JJ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
JPH4Q96JJ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
JPH4Q96JJ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
JPH4Q96JJ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
JPH4Q96JJ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
JPH4Q96JJ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
JPH4Q96JJ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
JPH4Q96JJ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
JPH4Q96JJ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
JPH4Q96JJ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
JPH4Q96JJ6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
JPH4Q96JJ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
JPH4Q96JJ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
JPH4Q96JJ6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
JPH4Q96JJ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
JPH4Q96JJ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
JPH4Q96JJ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC43.89■■■■■ 4.62
JPH4Q96JJ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
JPH4Q96JJ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.62
JPH4Q96JJ6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
JPH4Q96JJ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
JPH4Q96JJ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
JPH4Q96JJ6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
JPH4Q96JJ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
JPH4Q96JJ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
JPH4Q96JJ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
JPH4Q96JJ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.81■■■■■ 4.6
JPH4Q96JJ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
JPH4Q96JJ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
JPH4Q96JJ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
JPH4Q96JJ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
JPH4Q96JJ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
JPH4Q96JJ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
JPH4Q96JJ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
JPH4Q96JJ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
JPH4Q96JJ6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
JPH4Q96JJ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
JPH4Q96JJ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
JPH4Q96JJ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
JPH4Q96JJ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
JPH4Q96JJ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC43.69■■■■■ 4.58
JPH4Q96JJ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
JPH4Q96JJ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
JPH4Q96JJ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
JPH4Q96JJ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
JPH4Q96JJ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
JPH4Q96JJ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
JPH4Q96JJ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
JPH4Q96JJ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
JPH4Q96JJ6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
JPH4Q96JJ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
JPH4Q96JJ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
JPH4Q96JJ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.53■■■■■ 4.56
JPH4Q96JJ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
JPH4Q96JJ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
JPH4Q96JJ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
JPH4Q96JJ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
JPH4Q96JJ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
JPH4Q96JJ6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
JPH4Q96JJ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
JPH4Q96JJ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
JPH4Q96JJ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
JPH4Q96JJ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
JPH4Q96JJ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
JPH4Q96JJ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
JPH4Q96JJ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
JPH4Q96JJ6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.44■■■■■ 4.54
JPH4Q96JJ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
JPH4Q96JJ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
JPH4Q96JJ6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
JPH4Q96JJ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
JPH4Q96JJ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
JPH4Q96JJ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
JPH4Q96JJ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
JPH4Q96JJ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
JPH4Q96JJ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
JPH4Q96JJ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
JPH4Q96JJ6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
JPH4Q96JJ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
JPH4Q96JJ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
JPH4Q96JJ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
JPH4Q96JJ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
JPH4Q96JJ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms