Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC97Q96F63 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC97Q96F63 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC97Q96F63 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC97Q96F63 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC97Q96F63 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC97Q96F63 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms