Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ROPN1LQ96C74 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ROPN1LQ96C74 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ROPN1LQ96C74 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ROPN1LQ96C74 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ROPN1LQ96C74 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ROPN1LQ96C74 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ROPN1LQ96C74 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms