Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RNF34Q969K3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF34Q969K3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF34Q969K3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF34Q969K3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF34Q969K3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF34Q969K3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF34Q969K3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF34Q969K3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF34Q969K3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF34Q969K3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF34Q969K3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF34Q969K3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF34Q969K3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF34Q969K3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RNF34Q969K3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF34Q969K3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF34Q969K3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF34Q969K3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF34Q969K3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF34Q969K3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF34Q969K3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF34Q969K3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms