Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3AQ92664 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3AQ92664 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3AQ92664 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF3AQ92664 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GTF3AQ92664 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GTF3AQ92664 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms