Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH2

JPH3, Junctophilin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH3Q8WXH2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
JPH3Q8WXH2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
JPH3Q8WXH2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
JPH3Q8WXH2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
JPH3Q8WXH2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
JPH3Q8WXH2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms