Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SKA2Q8WVK7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKA2Q8WVK7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKA2Q8WVK7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKA2Q8WVK7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SKA2Q8WVK7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKA2Q8WVK7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKA2Q8WVK7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms