Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCA0

LRRC20, Leucine-rich repeat-containing protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC20Q8TCA0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC20Q8TCA0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC20Q8TCA0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC20Q8TCA0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC20Q8TCA0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC20Q8TCA0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC20Q8TCA0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC20Q8TCA0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC20Q8TCA0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC20Q8TCA0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC20Q8TCA0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC20Q8TCA0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC20Q8TCA0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC20Q8TCA0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms