Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA94

ZNF563, Zinc finger protein 563, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF563Q8TA94 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF563Q8TA94 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF563Q8TA94 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF563Q8TA94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF563Q8TA94 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF563Q8TA94 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF563Q8TA94 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF563Q8TA94 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF563Q8TA94 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF563Q8TA94 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF563Q8TA94 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF563Q8TA94 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF563Q8TA94 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF563Q8TA94 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF563Q8TA94 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF563Q8TA94 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF563Q8TA94 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms