Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KNL1Q8NG31 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KNL1Q8NG31 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KNL1Q8NG31 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KNL1Q8NG31 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KNL1Q8NG31 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KNL1Q8NG31 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KNL1Q8NG31 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KNL1Q8NG31 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KNL1Q8NG31 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KNL1Q8NG31 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KNL1Q8NG31 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KNL1Q8NG31 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KNL1Q8NG31 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KNL1Q8NG31 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KNL1Q8NG31 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KNL1Q8NG31 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.8 ms