Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP3

DNAAF1, Dynein assembly factor 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF1Q8NEP3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF1Q8NEP3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF1Q8NEP3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF1Q8NEP3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF1Q8NEP3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF1Q8NEP3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF1Q8NEP3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF1Q8NEP3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF1Q8NEP3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF1Q8NEP3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF1Q8NEP3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAAF1Q8NEP3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNAAF1Q8NEP3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAAF1Q8NEP3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF1Q8NEP3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF1Q8NEP3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.2 ms