Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDM7

CFAP43, Cilia- and flagella-associated protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP43Q8NDM7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CFAP43Q8NDM7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CFAP43Q8NDM7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
CFAP43Q8NDM7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CFAP43Q8NDM7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CFAP43Q8NDM7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
CFAP43Q8NDM7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CFAP43Q8NDM7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CFAP43Q8NDM7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CFAP43Q8NDM7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CFAP43Q8NDM7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CFAP43Q8NDM7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CFAP43Q8NDM7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CFAP43Q8NDM7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CFAP43Q8NDM7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
CFAP43Q8NDM7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CFAP43Q8NDM7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CFAP43Q8NDM7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CFAP43Q8NDM7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CFAP43Q8NDM7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CFAP43Q8NDM7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CFAP43Q8NDM7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CFAP43Q8NDM7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CFAP43Q8NDM7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CFAP43Q8NDM7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CFAP43Q8NDM7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CFAP43Q8NDM7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CFAP43Q8NDM7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CFAP43Q8NDM7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CFAP43Q8NDM7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CFAP43Q8NDM7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CFAP43Q8NDM7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CFAP43Q8NDM7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CFAP43Q8NDM7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CFAP43Q8NDM7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CFAP43Q8NDM7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CFAP43Q8NDM7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CFAP43Q8NDM7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CFAP43Q8NDM7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CFAP43Q8NDM7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
CFAP43Q8NDM7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CFAP43Q8NDM7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CFAP43Q8NDM7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
CFAP43Q8NDM7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CFAP43Q8NDM7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CFAP43Q8NDM7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CFAP43Q8NDM7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CFAP43Q8NDM7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CFAP43Q8NDM7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CFAP43Q8NDM7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CFAP43Q8NDM7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CFAP43Q8NDM7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CFAP43Q8NDM7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CFAP43Q8NDM7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CFAP43Q8NDM7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CFAP43Q8NDM7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CFAP43Q8NDM7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
CFAP43Q8NDM7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CFAP43Q8NDM7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CFAP43Q8NDM7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms