Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM229BQ8NBD8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM229BQ8NBD8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM229BQ8NBD8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM229BQ8NBD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM229BQ8NBD8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM229BQ8NBD8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM229BQ8NBD8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM229BQ8NBD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM229BQ8NBD8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM229BQ8NBD8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM229BQ8NBD8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM229BQ8NBD8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM229BQ8NBD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM229BQ8NBD8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229BQ8NBD8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms