Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDPD1Q8N9F7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GDPD1Q8N9F7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GDPD1Q8N9F7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GDPD1Q8N9F7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GDPD1Q8N9F7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GDPD1Q8N9F7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD1Q8N9F7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD1Q8N9F7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GDPD1Q8N9F7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDPD1Q8N9F7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD1Q8N9F7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDPD1Q8N9F7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms