Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8F6

YIPF7, Protein YIPF7, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF7Q8N8F6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
YIPF7Q8N8F6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YIPF7Q8N8F6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF7Q8N8F6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF7Q8N8F6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF7Q8N8F6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF7Q8N8F6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms