Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6N7

ACBD7, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD7Q8N6N7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACBD7Q8N6N7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACBD7Q8N6N7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ACBD7Q8N6N7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACBD7Q8N6N7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACBD7Q8N6N7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACBD7Q8N6N7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ACBD7Q8N6N7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACBD7Q8N6N7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACBD7Q8N6N7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACBD7Q8N6N7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACBD7Q8N6N7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACBD7Q8N6N7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACBD7Q8N6N7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACBD7Q8N6N7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACBD7Q8N6N7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACBD7Q8N6N7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACBD7Q8N6N7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACBD7Q8N6N7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms