Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA5Q8N114 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SHISA5Q8N114 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHISA5Q8N114 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHISA5Q8N114 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHISA5Q8N114 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHISA5Q8N114 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms