Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARP9Q8IXQ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARP9Q8IXQ6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARP9Q8IXQ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP9Q8IXQ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARP9Q8IXQ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PARP9Q8IXQ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms