Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUK5

PLXDC1, Plexin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1Q8IUK5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXDC1Q8IUK5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXDC1Q8IUK5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLXDC1Q8IUK5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXDC1Q8IUK5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXDC1Q8IUK5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXDC1Q8IUK5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXDC1Q8IUK5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXDC1Q8IUK5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLXDC1Q8IUK5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXDC1Q8IUK5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXDC1Q8IUK5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXDC1Q8IUK5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLXDC1Q8IUK5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXDC1Q8IUK5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXDC1Q8IUK5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms