Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF554Q86TJ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF554Q86TJ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF554Q86TJ5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF554Q86TJ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF554Q86TJ5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF554Q86TJ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms