Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SRGAP1Q7Z6B7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SRGAP1Q7Z6B7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRGAP1Q7Z6B7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SRGAP1Q7Z6B7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRGAP1Q7Z6B7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRGAP1Q7Z6B7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRGAP1Q7Z6B7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRGAP1Q7Z6B7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRGAP1Q7Z6B7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRGAP1Q7Z6B7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRGAP1Q7Z6B7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRGAP1Q7Z6B7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRGAP1Q7Z6B7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRGAP1Q7Z6B7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP1Q7Z6B7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRGAP1Q7Z6B7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRGAP1Q7Z6B7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP1Q7Z6B7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms