Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
FGD6Q6ZV73 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
FGD6Q6ZV73 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
FGD6Q6ZV73 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
FGD6Q6ZV73 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
FGD6Q6ZV73 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
FGD6Q6ZV73 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
FGD6Q6ZV73 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
FGD6Q6ZV73 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
FGD6Q6ZV73 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
FGD6Q6ZV73 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
FGD6Q6ZV73 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
FGD6Q6ZV73 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
FGD6Q6ZV73 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
FGD6Q6ZV73 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
FGD6Q6ZV73 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.92■■■■■ 4.14
FGD6Q6ZV73 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
FGD6Q6ZV73 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FGD6Q6ZV73 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
FGD6Q6ZV73 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
FGD6Q6ZV73 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
FGD6Q6ZV73 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
FGD6Q6ZV73 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
FGD6Q6ZV73 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
FGD6Q6ZV73 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
FGD6Q6ZV73 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
FGD6Q6ZV73 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
FGD6Q6ZV73 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
FGD6Q6ZV73 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
FGD6Q6ZV73 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
FGD6Q6ZV73 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
FGD6Q6ZV73 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.73■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.71■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
FGD6Q6ZV73 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
FGD6Q6ZV73 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
FGD6Q6ZV73 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
FGD6Q6ZV73 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
FGD6Q6ZV73 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
FGD6Q6ZV73 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
FGD6Q6ZV73 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
FGD6Q6ZV73 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
FGD6Q6ZV73 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
FGD6Q6ZV73 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
FGD6Q6ZV73 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
FGD6Q6ZV73 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
FGD6Q6ZV73 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
FGD6Q6ZV73 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
FGD6Q6ZV73 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
FGD6Q6ZV73 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms