Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNT2Q6UVM3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNT2Q6UVM3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNT2Q6UVM3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNT2Q6UVM3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNT2Q6UVM3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNT2Q6UVM3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNT2Q6UVM3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms