Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A4Q6P1M0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A4Q6P1M0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A4Q6P1M0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC27A4Q6P1M0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A4Q6P1M0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms