Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDE2Q6IQ49 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDE2Q6IQ49 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDE2Q6IQ49 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDE2Q6IQ49 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDE2Q6IQ49 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDE2Q6IQ49 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDE2Q6IQ49 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDE2Q6IQ49 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDE2Q6IQ49 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDE2Q6IQ49 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDE2Q6IQ49 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDE2Q6IQ49 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDE2Q6IQ49 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SDE2Q6IQ49 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDE2Q6IQ49 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDE2Q6IQ49 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDE2Q6IQ49 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDE2Q6IQ49 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDE2Q6IQ49 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDE2Q6IQ49 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDE2Q6IQ49 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDE2Q6IQ49 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDE2Q6IQ49 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SDE2Q6IQ49 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDE2Q6IQ49 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDE2Q6IQ49 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDE2Q6IQ49 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDE2Q6IQ49 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDE2Q6IQ49 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDE2Q6IQ49 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SDE2Q6IQ49 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.5 ms