Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMYD5Q6GMV2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMYD5Q6GMV2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMYD5Q6GMV2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD5Q6GMV2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD5Q6GMV2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD5Q6GMV2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMYD5Q6GMV2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SMYD5Q6GMV2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMYD5Q6GMV2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMYD5Q6GMV2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMYD5Q6GMV2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMYD5Q6GMV2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMYD5Q6GMV2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMYD5Q6GMV2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMYD5Q6GMV2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMYD5Q6GMV2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD5Q6GMV2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD5Q6GMV2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMYD5Q6GMV2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMYD5Q6GMV2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMYD5Q6GMV2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMYD5Q6GMV2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMYD5Q6GMV2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMYD5Q6GMV2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMYD5Q6GMV2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMYD5Q6GMV2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMYD5Q6GMV2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms