Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC181Q5TID7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC181Q5TID7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC181Q5TID7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC181Q5TID7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC181Q5TID7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC181Q5TID7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC181Q5TID7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC181Q5TID7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC181Q5TID7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC181Q5TID7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC181Q5TID7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC181Q5TID7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC181Q5TID7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC181Q5TID7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC181Q5TID7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC181Q5TID7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC181Q5TID7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC181Q5TID7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC181Q5TID7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC181Q5TID7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC181Q5TID7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC181Q5TID7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC181Q5TID7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC181Q5TID7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC181Q5TID7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC181Q5TID7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC181Q5TID7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC181Q5TID7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC181Q5TID7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC181Q5TID7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC181Q5TID7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC181Q5TID7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC181Q5TID7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC181Q5TID7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC181Q5TID7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC181Q5TID7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC181Q5TID7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC181Q5TID7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC181Q5TID7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms