Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00242Q5T6M2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00242Q5T6M2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00242Q5T6M2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00242Q5T6M2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00242Q5T6M2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms