Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDSS1Q5T2R2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDSS1Q5T2R2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PDSS1Q5T2R2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDSS1Q5T2R2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDSS1Q5T2R2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms