Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HP1BP3Q5SSJ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HP1BP3Q5SSJ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HP1BP3Q5SSJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HP1BP3Q5SSJ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HP1BP3Q5SSJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HP1BP3Q5SSJ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HP1BP3Q5SSJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HP1BP3Q5SSJ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HP1BP3Q5SSJ5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HP1BP3Q5SSJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HP1BP3Q5SSJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HP1BP3Q5SSJ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HP1BP3Q5SSJ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HP1BP3Q5SSJ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HP1BP3Q5SSJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HP1BP3Q5SSJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HP1BP3Q5SSJ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HP1BP3Q5SSJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HP1BP3Q5SSJ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HP1BP3Q5SSJ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HP1BP3Q5SSJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HP1BP3Q5SSJ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HP1BP3Q5SSJ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HP1BP3Q5SSJ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HP1BP3Q5SSJ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HP1BP3Q5SSJ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HP1BP3Q5SSJ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HP1BP3Q5SSJ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HP1BP3Q5SSJ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HP1BP3Q5SSJ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HP1BP3Q5SSJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms