Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIA3Q5JRA6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MIA3Q5JRA6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MIA3Q5JRA6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIA3Q5JRA6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIA3Q5JRA6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIA3Q5JRA6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIA3Q5JRA6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MIA3Q5JRA6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MIA3Q5JRA6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MIA3Q5JRA6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MIA3Q5JRA6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MIA3Q5JRA6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MIA3Q5JRA6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms