Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT12Q53H54 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT12Q53H54 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT12Q53H54 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT12Q53H54 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT12Q53H54 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT12Q53H54 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT12Q53H54 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRMT12Q53H54 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT12Q53H54 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT12Q53H54 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT12Q53H54 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT12Q53H54 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT12Q53H54 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT12Q53H54 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT12Q53H54 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT12Q53H54 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT12Q53H54 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT12Q53H54 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT12Q53H54 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms