Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIR3

EIF2S3L, Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF2S3LQ2VIR3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF2S3LQ2VIR3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF2S3LQ2VIR3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF2S3LQ2VIR3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF2S3LQ2VIR3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIF2S3LQ2VIR3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF2S3LQ2VIR3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIF2S3LQ2VIR3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIF2S3LQ2VIR3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF2S3LQ2VIR3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIF2S3LQ2VIR3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF2S3LQ2VIR3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIF2S3LQ2VIR3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF2S3LQ2VIR3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF2S3LQ2VIR3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF2S3LQ2VIR3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF2S3LQ2VIR3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF2S3LQ2VIR3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF2S3LQ2VIR3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF2S3LQ2VIR3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF2S3LQ2VIR3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms