Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CTC1Q2NKJ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTC1Q2NKJ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTC1Q2NKJ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTC1Q2NKJ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CTC1Q2NKJ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTC1Q2NKJ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CTC1Q2NKJ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTC1Q2NKJ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTC1Q2NKJ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTC1Q2NKJ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTC1Q2NKJ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTC1Q2NKJ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms