Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CNGA3Q16281 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGA3Q16281 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGA3Q16281 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGA3Q16281 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGA3Q16281 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGA3Q16281 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGA3Q16281 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA3Q16281 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA3Q16281 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGA3Q16281 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA3Q16281 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGA3Q16281 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNGA3Q16281 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGA3Q16281 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA3Q16281 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA3Q16281 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA3Q16281 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
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