Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SSPNQ14714 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SSPNQ14714 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SSPNQ14714 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSPNQ14714 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSPNQ14714 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSPNQ14714 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSPNQ14714 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSPNQ14714 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSPNQ14714 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSPNQ14714 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSPNQ14714 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSPNQ14714 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSPNQ14714 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSPNQ14714 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSPNQ14714 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSPNQ14714 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SSPNQ14714 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
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