Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF235Q14590 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF235Q14590 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF235Q14590 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF235Q14590 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF235Q14590 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF235Q14590 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF235Q14590 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF235Q14590 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF235Q14590 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF235Q14590 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF235Q14590 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF235Q14590 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF235Q14590 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF235Q14590 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF235Q14590 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF235Q14590 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF235Q14590 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF235Q14590 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF235Q14590 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF235Q14590 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF235Q14590 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF235Q14590 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF235Q14590 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF235Q14590 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF235Q14590 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF235Q14590 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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