Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLF9Q13886 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLF9Q13886 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KLF9Q13886 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLF9Q13886 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLF9Q13886 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLF9Q13886 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLF9Q13886 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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