Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TGM3Q08188 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGM3Q08188 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGM3Q08188 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TGM3Q08188 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TGM3Q08188 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TGM3Q08188 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGM3Q08188 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TGM3Q08188 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGM3Q08188 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TGM3Q08188 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGM3Q08188 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGM3Q08188 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGM3Q08188 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TGM3Q08188 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms