Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
POU5F1Q01860 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POU5F1Q01860 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
POU5F1Q01860 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
POU5F1Q01860 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
POU5F1Q01860 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POU5F1Q01860 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
POU5F1Q01860 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
POU5F1Q01860 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POU5F1Q01860 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
POU5F1Q01860 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POU5F1Q01860 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
POU5F1Q01860 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POU5F1Q01860 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POU5F1Q01860 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POU5F1Q01860 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POU5F1Q01860 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms