Protein–RNA interactions for Protein: P85037

FOXK1, Forkhead box protein K1, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK1P85037 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXK1P85037 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXK1P85037 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXK1P85037 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXK1P85037 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXK1P85037 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXK1P85037 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXK1P85037 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXK1P85037 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXK1P85037 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXK1P85037 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXK1P85037 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXK1P85037 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXK1P85037 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXK1P85037 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXK1P85037 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXK1P85037 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXK1P85037 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXK1P85037 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms