Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCL20P78556 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL20P78556 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCL20P78556 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL20P78556 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL20P78556 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCL20P78556 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL20P78556 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL20P78556 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCL20P78556 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL20P78556 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCL20P78556 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCL20P78556 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL20P78556 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL20P78556 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCL20P78556 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL20P78556 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCL20P78556 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCL20P78556 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL20P78556 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL20P78556 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCL20P78556 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL20P78556 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL20P78556 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL20P78556 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL20P78556 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL20P78556 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCL20P78556 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL20P78556 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL20P78556 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCL20P78556 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL20P78556 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCL20P78556 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL20P78556 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL20P78556 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL20P78556 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL20P78556 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL20P78556 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCL20P78556 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL20P78556 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL20P78556 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL20P78556 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCL20P78556 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCL20P78556 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCL20P78556 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL20P78556 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL20P78556 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCL20P78556 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCL20P78556 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCL20P78556 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCL20P78556 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCL20P78556 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCL20P78556 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCL20P78556 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCL20P78556 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCL20P78556 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCL20P78556 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCL20P78556 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCL20P78556 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCL20P78556 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCL20P78556 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCL20P78556 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCL20P78556 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCL20P78556 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCL20P78556 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCL20P78556 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCL20P78556 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCL20P78556 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCL20P78556 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCL20P78556 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCL20P78556 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCL20P78556 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCL20P78556 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCL20P78556 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCL20P78556 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCL20P78556 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCL20P78556 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCL20P78556 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCL20P78556 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCL20P78556 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCL20P78556 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCL20P78556 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCL20P78556 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCL20P78556 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCL20P78556 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCL20P78556 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCL20P78556 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCL20P78556 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCL20P78556 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCL20P78556 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCL20P78556 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCL20P78556 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCL20P78556 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCL20P78556 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCL20P78556 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCL20P78556 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCL20P78556 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL20P78556 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL20P78556 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCL20P78556 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms