Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HBBP68871 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HBBP68871 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HBBP68871 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HBBP68871 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HBBP68871 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HBBP68871 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HBBP68871 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HBBP68871 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HBBP68871 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HBBP68871 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HBBP68871 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HBBP68871 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HBBP68871 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HBBP68871 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HBBP68871 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HBBP68871 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HBBP68871 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HBBP68871 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HBBP68871 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HBBP68871 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HBBP68871 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HBBP68871 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HBBP68871 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HBBP68871 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HBBP68871 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HBBP68871 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HBBP68871 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HBBP68871 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HBBP68871 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HBBP68871 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HBBP68871 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HBBP68871 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HBBP68871 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HBBP68871 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HBBP68871 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HBBP68871 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HBBP68871 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HBBP68871 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HBBP68871 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HBBP68871 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HBBP68871 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HBBP68871 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HBBP68871 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HBBP68871 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HBBP68871 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HBBP68871 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HBBP68871 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HBBP68871 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HBBP68871 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HBBP68871 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HBBP68871 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HBBP68871 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HBBP68871 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HBBP68871 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HBBP68871 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HBBP68871 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HBBP68871 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HBBP68871 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HBBP68871 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HBBP68871 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HBBP68871 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HBBP68871 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HBBP68871 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HBBP68871 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBBP68871 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBBP68871 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBBP68871 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HBBP68871 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HBBP68871 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HBBP68871 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HBBP68871 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HBBP68871 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HBBP68871 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBBP68871 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBBP68871 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBBP68871 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HBBP68871 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HBBP68871 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HBBP68871 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBBP68871 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HBBP68871 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HBBP68871 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HBBP68871 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HBBP68871 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HBBP68871 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HBBP68871 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HBBP68871 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBBP68871 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBBP68871 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBBP68871 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBBP68871 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HBBP68871 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HBBP68871 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HBBP68871 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HBBP68871 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HBBP68871 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HBBP68871 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HBBP68871 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HBBP68871 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms