Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAMP2P63027 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAMP2P63027 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAMP2P63027 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VAMP2P63027 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAMP2P63027 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms