Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMC1P62191 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMC1P62191 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMC1P62191 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PSMC1P62191 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMC1P62191 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMC1P62191 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms